1960 年, 瑞士科学家观察到大肠杆菌内有一种限制性的核酸内切酶, 后來被美国科学家进一步证实并应用於遗传学的研究.结果表明, 大肠杆菌的限制性核酸内切酶可以成为切割DNA 分子的一把锐利的"剪刀".
1973 年, 美国科学家把大肠杆菌的两个不同的DNA 分子重新组合在一起, 然后把這个组合的DNA 引进大肠杆菌中, 结果重组的DNA 表现出了双亲的遗传特性.次年, 科恩等人又成功地將金黄色葡萄球菌的DNA 和大肠杆菌的DNA 重组在一起.接着, 他們又將高等动物青蛙的 DNA 与大肠杆菌的DNA 重组在一起.這些试验的成功, 表明各种生物在亿万年间所形成的种类之间的天然屏障, 开始在微小的大肠杆菌面前崩溃了.人类向合成生命的自由王国迈进了一大步.
大肠杆菌在人工合成基因方面也担当着重要角色.1977 年11 月, 美国一些著名科学家合作, 首次用人工合成基因移植到大肠杆菌内, 使大肠杆菌分泌出了极为珍贵的人脑激素——生长素的抑制素(简称SS).這是基因工程取得的第一项引起世界轰动的重大成果.此后不久, 美国另一研究组织宣布, 他們把人工合成的人体胰岛素基因转移到大肠杆菌内, 也获得成功, 并且生产出少量的胰岛素.這是大肠杆菌为基因工程创造的又一奇迹.现在科学家已经使用基因工程技术, 通过大肠杆菌來制造人的生长激素(HGH)、干扰素、尿激酶和镇痛化学物质β—内腓酞等.
最近, 遗传学家又把大肠杆菌分解的半乳糖基因切割下來, 装在一种噬菌体上, 放进病人的纤维细胞中, 借大肠杆菌的基因來治疗半乳糖血症(一种先天性的代谢缺陷症)获得成功, 从而使临床上采用基因疗法來根治遗传病的设想正在成为现实.预计应用基因工程技术來产生阻止癌细胞繁殖的基因, 以便彻底根治癌症的设想, 在不久的將來一定能够实现.
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